中共四川农业大学农学院党委共设16个支部，其中教工支部6个，研究生支部5个，本科生支部5个。
教工支部(6个):
教工行政党支部
教工作物遗传育种党支部
教工作物栽培学党支部
教工作特用植物生产学党支部
教工植物保护党支部
教工生态农业研究所党支部
研究生党支部(5个)
作物栽培与耕作学硕士生党支部
作物遗传育种学硕士生党支部
植物保护学研究生党支部
特用植物生产学研究生党支部
作物学博士生党支部
本科生党支部(5个)：
本科农学支部（农学专业）
本科烟草中药支部（烟草、中药专业）
本科农区支部（农区专业）
本科植保支部（植保专业）
本科植科种子支部（植科、种子专业）